上海医疗器械高等专科学校由国家卫生部于1960年创建。2003年5月，经上海市人民政府批准，学校划归上海理工大学管理，在继续进行并加强专科层次教育的同时，组建成立了上海理工大学医疗器械学院，进行医疗器械学科方向的本科教育。2008年入围教育部、财政部2008年度“国家示范性高等职业院校建设计划”重点培育院校。目前学校是国内唯一一所以“医疗器械”命名的、独立设置的专门培养医疗器械类高素质技能型人才的高等职业院校。

近半个世纪的办学沉淀，学校形成了医工结合、以工为主、兼容管理的办学特色，职前职后共举的办学方针、错位竞争的办学思路、职业针对性强的专业特点。学校紧贴市场需求，积极探索校企合作、工学交替、订单培养、顶岗实习等一系列具有行业特色的高层次职业技术人才培养模式，紧紧围绕重点专业建设，加大内涵建设力度，以国家示范性高等职业院校的建设作为学校建设和发展的目标。

学校成人教育工作开展于20世纪90年代，依托上海理工大学、上海医疗器械高等专科学校全日制师资力量和完备的教学设施，依托国家食品药品监督管理、医疗器械产业和医院设备管理行业背景，建立了精品课程为核心的教育体系，为国家培养了大批优秀的高级医疗器械专门人才。目前已经形成了多专业、多形式、多层次的成人高等教育体系。不仅有夜大学的学历教育，还接收来自全国医疗、医药等相关行业的人员培训学习，开办了各类职业技能资格培训班，以及医疗器械行业管理人员培训班等成人教育培训体系。