生态学专业（ (硕士、博士学位点071300）含森林生态学、林业生态工程学、恢复生态学、农业生态学、产业生态学、生态系统生态学、稳定同位素生态学、水文生态学、气候生态学、植物生态学、化学生态学、景观生态学、分子生态学、根际生态学等十四个研究方向。
森林生态学：研究森林生态系统结构、功能与动态演替；森林生态系统生物多样性及复杂性；森林健康评价与管理；森林质量、景观格局及环境效应；森林水生昆虫生态；森林界面生态过程；森林对全球气候变化的响应；树木生理生态特性及抗逆性机制与调控；天然林经营管理与保护对策；人工林土壤生态管理理论与技术；城市森林结构及生态服务功能；“3S”(GIS、RS、GPS)技术在森林资源管理中的应用。
林业生态工程学：研究防护林构建、培育及其生态学基础；防护林生态系统健康管理的理论与技术；林木种质资源选育及优化组合利用技术；退化立地生态恢复与植被重建；土地荒漠化形成的生态学机制及防治技术。
恢复生态学：研究生态系统退化过程与恢复途径；草地植物适应对策和草地植被多样性维持机制；沙地植被演替与人工植被稳定性；沙地生态系统生态需水与植被配置；退化草地的养分循环和调控机制；草地荒漠化监测。
农业生态学：研究农业生态系统的养分循环(农业生态系统养分平衡，土壤-作物-喂饲系统养分循环再利用，农田土壤磷肥残效和叠加效应，土壤中氮的矿化与固定，土壤-植物系统中氮的去向、转化与循环，农业系统养分调控管理与土壤肥培肥技术)；农业生态系统的水分循环(农田水量平衡与转换，提高作物水分利用效率的途径，农田生态系统水肥调控途径)；农业生态系统的结构与功能；农业系统的能量流动，生态农业与农业生态工程；人类活动对农业生态系统生产力及生态环境的长期影响等。
产业生态学：研究区域循环经济发展模式及优化演变路径；循环经济政策的量化评估方法；基于地理信息系统的循环经济决策支持系统建设；区域一体化环境技术与政策的评价方法；能值理论在循环经济与产业生态学领域的应用；区域生态承载力与生态足迹的分析方法；区域水资源的优化分配理论与方法；区域产业共生与节能减排模式；基于空间数据库的生态产业园规划理论与方法；生态补偿的理论与方法；清洁发展机制与循环经济。
生态系统生态学：研究生态系统的组成要素、分布、结构与功能及其内在联系，系统的发展与演替，系统内和系统间的能量流动和物质循环过程及其对自然和人为因素变化的响应与适应机制。
稳定同位素生态学：利用碳氮氧稳定同位素自然丰度技术，研究碳氮元素在大气圈、生物圈、土
壤圈的循环过程、交互作用及其对自然和人为干扰的响应。
水文生态学：研究森林、草原等主要生态系统水循环过程机制；生态系统结构影响降雨再分配、蒸散、坡面产汇流与流域径流过程机理；流域水文过程的模型与模拟；大型生态工程(包括林业生态工程、农业生态工程等)与水利工程建设对水文过程及对流域水资源的影响；生态破坏可能引起的水、旱灾害评价与预测；流域水循环过程对全球气候变化的响应。
气候生态学：研究森林、草原等生态系统关键物质（温室气体、水分）及能量的交换过程与机制；植被下垫面生态过程的观测与模拟；生态系统生产力机理与评价；大型生态工程(包括林业生态工程、农业生态工程等)建设的气象效应与生态效应；生态系统功能对气候变化的响应。
植物生态学：研究植物与环境因子(大气、光、水分等)之间的关系和相互作用；种子植物和孢子植物(菌物、苔藓、地衣等)的种群生态和群落生态；植物-微生物共生生态机理和调控；生物多样性，特别是珍稀濒危植物、菌物和重要资源植物、菌物的生态保护及持续利用。
景观生态学：以野外考察、遥感、地理信息系统和全球定位系统(3S)技术为主要手段，研究不同时空尺度景观的空间格局、生态过程与动态变化，建立景观指标体系与空间直观模型，进行区域景观评价与生态安全、区域景观格局变化与全球变化、区域生态规划与生态建设、自然保护区与森林公园的保护与生态旅游研究。
化学生态学：研究生态系统中植物与其它有机及环境通过次生物质为媒介的化学关系，特别是植物种间种内的化学作用。揭示植物种间的化学识别及信息传递机制，简明植物种间功能物质对土壤生物的影响及其迁移转化过程。
分子生态学：研究不同生态环境与植物进化的关系；不同生态环境对植物生存机制的影响；无环境污染的转基因植物技术的开发；利用植物基因工程方法修复污染生态环境等。
根际生态学： 研究植物根系与土壤界面在调解和控制生态过程中的作用与机制；根土界面在大气-植被-土壤连同体中的功能；根土互作用对环境变化的响应；根系动态对土壤碳氮转化的影响以及微生物群落的调控；土壤生物区系和生化过程对植物生长的反馈。沈阳应用生态研究所2013
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